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空間轉錄組數據中的統計方法

時間:2024-06-03 10:23    來源:     閱讀:

光華講壇——社會名流與企業家論壇第6549

空間轉錄組數據中的統計方法

主講人香港中文大學(深圳)數據科學學院 劉瑾副教授

主持人統計學院 林華珍教授

時間:5月31日 16:00-17:00

舉辦地點柳林校區弘遠樓408會議室

主辦單位:統計研究中心和統計學院 科研處

主講人簡介:

劉瑾博士,香港中文大學(深圳)數據科學學院副教授、校長學者。曾任新加坡國立大學Duke-NUS醫學院助理教授,芝加哥伊利諾大學助理教授。主要參與統計計算及其在統計遺傳/基因組學中的應用研究,當前研究方向包括TWAS(全轉錄組關聯分析)、孟德爾隨機和單細胞、空間轉錄組數據整合研究。作為第一/通信作者把相關系列研究發表在 Nature Communications, Nucleic Acids Research, Gut, Briefings in Bioinformatics, Bioinformatics, Biometrics, Biostatistics,IEEE Transactions on Information Theory等雜志,迄今為止發表SCI論文80余篇。四次獲得新加坡教育部頒發的學術研究基金(AcRF Tier 2),獲得國家自然科學基金面上項目資助。?

內容簡介

空間分辨轉錄組學(spatially resolved transcriptomics,SRT)包含一組最新開發的生物技術,這些技術可同時表征組織的基因表達譜,并且保留有關其物理位置的信息。因此,SRT組學提供了與組織切片相關的基因表達模式的圖譜排列,能夠將結構和活性相連接,使研究人員能夠在細胞水平上闡明生物之間的相互作用,從而為復雜組織(如腫瘤微環境)提供新的見解。報告人將針對SRT數據分析的幾個統計問題,提出解決方案,利用SRT數據發現新的生物學(癌癥)機制。

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